Для управления доступом к файлам и каталогам устанавливаются права доступа. Доступ к файлу или каталогу может быть разрешен для чтения, записи и выполнения по трем категориям: владелец, группа и прочие пользователи. Разрешения устанавливаются с помощью команды chinod, a команда ls с опцией -l выдает список файлов и каталогов с текущими правами доступа

Различные запоминающие устройства содержат собственные файловые системы, которые можно объединять в общую файловую структуру и к которым затем можно обращаться. Вы можете обращаться к CD-ROM, дискетам и разделам жесткого диска. Кроме того, можно монтировать разделы MS-DOS жесткого диска и обращаться к ним непосредственно из системы Linux Если поместить в файл /etc/fstab запись для какой-нибудь файловой системы, она будет автоматически монтироваться при начальной загрузке. Если ваш компьютер включен в сеть, можно монтировать файловые системы с удаленного сервера и обращаться к ним.

Для пересылки и резервного копирования файлов их можно архивировать и сжимать Команда tar служит для архивирования файлов, а команда gzip ≈ для их сжатия. Программные пакеты, предлагаемые удаленными источниками, в большинстве своем и архивированы, и сжаты. Их имена обычно имеют окончание tar.gz . Их можно загрузить с удаленного сервера, распаковать с помощью команды gunzip, а затем разархивировать посредством команды tar Инсталляция этого программного обеспечения может осуществляться при помощи команды rpm.